2000-2001: 17° in  A (retrocesso in B)

Da sinistra, in piedi: Stellone, Fresi, Baldini, Vidigal, Coppola; in ginocchio, Bellucci, Matuzalem, Sesa, Saber, G. Tedesco, Baccin.

Formazione tipo: Mancini, Troise, Fresi, Quiroga, Baccin, Jankulowski, Amoruso, Matuzalem,  Pecchia, Vidigal, Bellucci.

Allenatore: Zdenek Zeman (poi Emiliano Mondonico)
2001-2002: 5° in B

Da sinistra, in piedi: Mancini, Baccin, Caruso, Stellone, Villa, Bocchetti, Husain, Magoni, Alessi, Bonomi, Moriero.

Formazione tipo: Mancini, Villa, Luppi, Bonomi, Baccin, Jankulowski, Magoni, Graffiedi, Stellone, Montezine, Rastelli.

Allenatore: Luigi De Canio.

 
2002-2003: 16° in  B

Da sinistra, in prima fila: Marcolin, Dionigi, Saber, Gragnianiello, Mancini, Manitta, Quadrini, Baldini, Bocchetti; in seconda fila, un dipendente, il medico sociale, dr, Russo, D’Angelo, Savino, Troise, il vice-allenatore, l’allenatore Scoglio, Floro Flores, Stendardo, l’addetto Stampa, Vigliotti, Albarella; in terza fila, Vidigal, Stellone, Pasino, Sesa, Martinez, Bonomi, Montervino, Montezine, Villa.

Formazione tipo: Mancini, Baldini, Troise, Bonomi, Bocchetti, Marcolin, Vidigal, Montezine, Dionigi, Stellone, Floro Flores.

Allenatore: Franco Colomba (poi Franco Scoglio e di nuovo Colomba)

 
2003-2004: 14° in  B (retrocesso in C)

La retrocessione è conseguenza del fallimento della Società.

Da sinistra, in piedi: Portanova, Civitanovic, Floro Flores, Tosto, Vidigal, Manitta; accosciati, Olive, Sogliano, Savoldi, Zanini, Marcolin.

Formazione tipo: Manitta, Portanova, Zamboni, Bonomi, Tosto, Bernini, Marcolin, Vidigal, Zanini, Dionigi, Savoldi.

Allenatore: Andrea Agostinelli (poi Simoni)

 
2004-2005: 3° in  C

Nasce il Napoli Soccer

In prima fila: il medico, dr. Canonico, Accursi, Giubilato, Sosa, Renard, Gianello, Saviano, Scarlato, Ignoffo, Romito;  seconda fila, Schettino, Mora, Terzi, Calaiò, Fontana,  Reja, Corrent, Montesanto, Consonni, Esposito G, il dirigente accompagnatore E. De Laurentis; in terza fila, il fisioterapista De Novellis, il vice-allenatore Caffarelli, Pià, Abate, Gatti, Grava, Capparelli, Bonomi, Montervino, Carmando,  Sguazzero.

Formazione tipo: Gianello, Grava, Ignoffo, Giubilato, Bonomi, Montervino Fontana, Capparella, Calaiò, Sosa, Pià

Allenatore: Giampiero Ventura (poi Edy Reja).
 
2005-2006: 1° in C (promosso in B)

Da sinistra: Giubilato, Fontana, Maldonado, Montervino, Romito, Pià, Iezzo, Calaiò, Bogliacino, Capparella, Grava.

Formazione tipo: Iezzo, Grava, Maldonado, Romito, Giubilato, Fontana, Bogliacino, Montervino, Calaiò, Capparella, Pià.
 

Allenatore: Edy Reja.
2006-2007 : 2° in B
(promosso in A)

 
 
Riacquista  in Serie B la denominazione S. S. C. Napoli.


Da sinistra: Maldonado, Cannavaro II, Bucchi, Iezzo, Domizzi, Savino; accosciati, De Zerbi, Montervino, Pia, Bogliacino, Amodio.

Formazione tipo: Iezzo, Grava, Cannavaro, Domizzi, Savini; Montervino, Bogliacino, Della Bona,  De Zerbi, Sosa, Calaiò.
Allenatore
: Edy Reja

2007-2008 : 8° in A

Da sinistra: Savini, Domizzi, Hamsik, Contini, Bogliacino, Gargano, Cannavaro, Garics, Zalayeta, Lavezzi, Iezzo

Formazione tipo: Iezzo, Grava, Cannavaro, Domizzi, Santacroce; Blasi, Gargano, Hamsik,  Bogliacino,Zalayeta, Lavezzi.
Allenatore
: Edy Reja
2008-2009: 12° in A

Da sinistra: Iezzo, Gargano, Zalayeta, Aronica, Vitale, Pazienza, Pià, Santacroce, Rinaudo, Blasi, Montervino

Formazione tipo: Iezzo, Cannavaro, Contini, Aronica;  Maggio, Blasi, Gargano, Hamsik,  Vitale; Zalayeta, Lavezzi.
Allenatore
: Edy Reja (poi Roberto Donadoni)

2009-2010 : 6° in A

Da sinistra in alto: Cannavaro, Maggio, De Sanctis, Campagnaro, Datolo, Contini; accosciati: Quagliarella, Gargano, Bogliacino, Hamsik, Lavezzi

Formazione tipo: De Sanctis, Grava, Cannavaro, Aronica, Campagnaro; Maggio. Pazienza, Gargano, Hamsik; Quagliarella, Lavezzi.
Allenatore
: Roberto Donadoni (poi Walter Mazzarri)